過敏症は自己の組織に損傷を与える免疫応答である。これは機構と過敏反応が起きる時間経過に基づいて、4クラスに分けられる。I型過敏症は即時的な反応あるいはアナフィラキシー反応で、しばしばアレルギーに付随している。症状は穏やかな不快さから死に至るまで幅広い。I型過敏症はマスト細胞や好塩基球が分泌するIgEが原因である。 II型過敏症は抗体が自己の細胞の抗原に結合してそれを破壊するようマークを付けることから起こる。これは抗体依存性（あるいは細胞傷害性）過敏症と呼ばれ、IgGやIgM抗体が原因である。 免疫複合体（抗原の凝集、補体タンパク質、およびIgGとIgM抗体）が様々な組織で沈着するとIII型過敏症の反応が引き起こされる。IV型過敏症は（細胞媒介性あるいは遅延型過敏症としても知られるが）生じるまでに普通は2?3日かかる。IV型の反応は多くの自己免疫病や感染症で見られるが、接触皮膚炎（ツタウルシ）にも見られる場合がある。これらの反応に関与しているのはT細胞、単球およびマクロファージである。
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無脊椎動物はリンパ球を生み出していないし、抗体に基づいた体液性反応も生み出していないので多要素からなる適応免疫系は最初の脊椎度物に生じたと思われる。しかし多くの種は脊椎度物の免疫のこれらの諸面の前駆機能として発現させている機構を活用している。免疫系は生物の機能構造としては最も簡単なものでさえあると見受けられる。細菌はバクテリオファージと呼ばれるウイルス病原体から守るために制限修飾系と呼ばれるユニークな防御機構を用いている。